Le Conseil de fondation s’appuie sur une structure organisée autour d’une équipe de direction, de quatre commissions et de plusieurs jurys. Au total, la Fondation Leenaards bénéficie de l’apport d’une cinquantaine de personnes au bénéfice d’un haut niveau d’expertise. En termes de gouvernance, elle s’inspire du Swiss Foundation Code (voir rubrique gouvernance).
La Fondation est un membre actif de Swissfoundations, l’association faîtière des fondations donatrices suisses. En termes de gouvernance, elle s’inspire du Swiss Foundation Code. Elle applique notamment trois principes en vue de gérer de potentiels conflits d’intérêts au sein de ses organes :